bioRxiv（Neuroscience）· Darwin Babino·2026-11-03 08:00· 16 小时前AI 评分38

PHASOR：开源视网膜多电极阵列群体活动隐马尔可夫模型分析流程

PHASOR: An Open-Source Pipeline for Hidden Markov Model Analysis of Stimulus-Locked Retinal Multielectrode-Array Population Activity

AI 导读

PHASOR 是一套开源流程，将刺激时钟对齐、基于傅里叶的响应分类、带 Chow-Liu 树发射的隐马尔可夫模型、模型阶数选择与状态可视化整合为可复用工作流，用于把视网膜多电极阵列记录的群体活动与刺激时序和单细胞响应关联起来。

AI 要点

团队

Darwin Babino（bioRxiv 预印本，作者单位原文未提及）

主要结果

10 个含 7 个生成状态的合成数据集中，选中模型阶数为 7–9、均值 7.9，3 个数据集与生成数完全一致；代表性记录中解码状态在占据率、驻留时间和活跃单元组成上不同。

解决什么问题

把刺激时钟对齐、基于傅里叶的响应分类、带 Chow-Liu 树发射的隐马尔可夫建模、模型阶数选择与状态可视化整合为可复用流程。

方法

用合成群体评估，并在 3 只野生型视网膜（2 雄 1 雌）和 1 只雄性 rd1 视网膜的 10 次离体记录上演示，含 2 Hz 全视野正弦刺激。

局限

原文称所选状态只是群体活动的描述性模型，其数量与生物组装体的对应关系需另行验证；从研究设计看，为离体记录与合成数据评估。

AI 依据原文整理，未经人工核对。